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Nature Communications | 开发可应用于基因治疗的高保真RNA基因编辑技术

发布时间:2026-02-26

RNA碱基编辑能够在RNA水平上精确修复致病突变,目前正受到越来越多的关注。但目前基于工程化ADAR脱氨酶的RNA编辑方法还存在着广泛的脱靶效应,限制了其临床应用。

2月25日,由beat365在线体育app生物医学与健康工程研究所路中华研究员领衔的研究团队,在Nature Communications期刊上发表研究成果,题目为“Target-Stabilized Base Editors Enable Robust High-Fidelity RNA Editing”。团队成功开发了一种名为 “RECODE”(RNA editing with conditionally stable and enhanced ADAR1 deaminase variants)的新型高保真RNA碱基编辑系统并在动物模型中验证了其治疗潜力,有力地推动了RNA碱基编辑向临床应用迈进。

在基因治疗领域,碱基编辑技术因其能够直接修正致病性点突变而备受瞩目。与在DNA层面进行永久性改变的编辑策略相比,在RNA水平进行编辑具有可逆性和可调节性的独特优势,因此被视为一种潜在更安全的治疗途径。其中,基于工程化脱氨酶(如ADAR脱氨酶)的RNA碱基编辑器发展迅速。然而,该系统目前还存在显著的、全转录组脱靶风险。其核心原因是游离的脱氨酶在无 gRNA 情况下仍可作用于大量的内源性RNA,这是其迈向临床应用的重要障碍之一。

为减少脱靶效应,本研究创造性地应用了“条件性稳定”的设计理念。研究团队对ADAR1脱氨酶结构域(ADAR1d)进行了改造,为其添加了特异性的蛋白降解标签,使其在细胞内处于快速降解的不稳定状态。只有当设计的gRNA与靶标RNA结合时,会诱导gRNA发生构象转换,进而“保护”并稳定与之结合的ADAR1d,使其免于降解并发挥编辑活性。这种“靶标稳定”的机制,确保了脱氨酶的活性被严格限定在目标RNA位置,实现了编辑活性的空间精准控制(图1)。结合对ADAR1d本身进行的结构引导理性工程优化,RECODE系统最终实现了高保真与高效率的统一。

在基因治疗转化应用层面,RECODE系统展现了强大的治疗潜力。研究团队成功利用其在小鼠中高效纠正了与肌萎缩侧索硬化症(Amyotrophic Lateral Sclerosis,ALS)相关的FUS基因突变(图2),有效逆转了突变导致的FUS蛋白在神经元轴突中的错误定位。此外,RECODE还成功将治疗性突变引入Angptl3基因的RNA,在小鼠体内实现了持久且显著的血浆脂质水平降低,为心血管代谢疾病的基因治疗提供了新策略(图3)。

综上所述,RECODE系统不仅提供了一种具有临床应用前景的高保真RNA编辑工具,而且揭示并验证了一条普适性的设计原则——通过效应蛋白的条件性稳定来增强RNA引导系统的特异性。这一原则有望拓展应用于其他基于RNA引导的蛋白质效应器比如CRISPR系统,推动该领域向更高特异性迈进。

该研究由beat365在线体育app生物医学与健康工程研究所、医学影像技术与系统全国重点实验室、深港脑科学创新研究院路中华、刘太安团队合作完成。路中华研究员是论文主要通讯作者,刘太安副研究员是论文第一作者/共同通讯作者,博士研究生林韵萍是论文共同第一作者。

论文链接

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图1 “靶标稳定”的RNA碱基编辑器RECODE

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图2 RECODE可逆转渐冻症相关FUS突变体在细胞质的异常累积

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图3 通过引入保护性突变,RECODE可显著减低小鼠血脂水平




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